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University of Duisburg and Essen, Aquatic Ecosystems Research Group, Universitätsstr. 5, D-45141 Essen, Germany

6th International Barcode of Life Conference

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Arne Beerman und Vasco Elbrecht haben auf der 6. Internationalen Barcode of Life Konference (iBOL)  in Guelph (Kanada) aktuelle Forschungsergebnisse vorgestellt. Arne Beerman hat in einem Vortrag morphologische Bestimmungen von Makroinvertebraten mit den Ergebnissen DNA-basierter Einteilungen verglichen und den aktuellen Stand der GeneStream-Referenzdatenbanken vorgestellt (Kooperation mit dem German Barcode of Life Project, GBOL). Vasco Elbrecht hat in einem […]

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Neue Publikation

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Wir freuen uns über eine neue Publikation von Vasco und Florian. Im der bei PLOS ONE erschienenen Studie konnten wir mit einem innovativem Laborprotokoll zeigen, dass Invertebraten über das neue DNA-Metabarcoding Verfahren sicher detektiert werden können, jedoch eine Aussage über die Häufigkeit der in der Probe vertretenen Taxa schwierig ist. Weitere Informationen gibt es in der Pressemeldung der Ruhr-Universität oder direkt bei […]

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Umzug an die Universität Duisburg-Essen

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Florian hat eine W2-Professur and der Universität Duisburg-Essen für das Fachgebiet „Aquatische Ökosytsemforschung“ zum 1.7.2015 angenommen. Das GeneStream-Team wird somit in den nächsten Wochen den großen Umzug von der Ruhr-Universität nach Essen durchführen und dort die hervorragenden neuen Labore beziehen. Die Kooperation mit dem Lehrstuhl für Evolutionsökologie und Biodiversität der Tiere an der Ruhr-Universität werden […]

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Laborzuwachs: Gewebehomogenisator für Metabarcoding

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Mit der  DNA-Metabarcoding Technik können hunderte Individuen in Invertebratenproben auf einmal auf Artlevel bestimmt werden. Diese molekulare Methode besitzt großes Potenzial für die Gewässerbewertung. Wir konnten bereits zeigen, dass die Homogenisation des Gewebes besonders wichtig ist. Für unsere zukünftigen Proben haben wir daher einen neuen Gewebe-Homogenisator für das Labor angeschafft, welcher die Bearbeitung der Proben […]

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Besuch bei Andres Aguilar (California State University)

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Letzten Montag hat Vasco Andres Aguilar von der California State University besucht, um eDNA Methoden zum Erkennen von invasiven Arten sowie Metabacoding zu diskutieren. Wir bedanken uns bei Andy für die interessanten Gespräche und Gastfreundschaft, so wie bei der RUB Research School für die Finanzierung des Aufenthalts. Foto 1: Blick ins molekulare labor in dem Andy und […]

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SWS meeting 2015!

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Auch auf der SWS Konferenz 2015 (Providence, Rhode Island, US) haben wir unsere Ergebnisse vorgestellt. Vasco hatte zudem die Gelegenheit sich vor allem mit Kollegen von der Universität Guelph über aktuelle Metabarcoding- Vorhaben und Ergebnisse auszutauschen. Wir bedanken uns bei der Rub Research School Plus für die Finanzierung dieses Aufenthalts. Video: Die auf der Konferenz vorgestellten Inhalte sind in […]

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Gastwissenschaftler Teheran

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Wir freuen uns Ahmad-Reza Katouzian und seine Frau Mona von der Universität Teheran in unserer Gruppe zu begrüßen. Ahmad-Reza forscht im Rahmen seiner Doktorarbeit an der Ausbreitungsgeschichte iranischer Amphipoden. Bei uns wird er hierfür in seinem 6-monatigen Aufenthalt die nötigen genetischen Untersuchungen durchführen und die Daten auswerten. Herzlich willkommen!   Foto 1: Unsere Gäste für […]

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Crashkurs in Science Communication

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Wissenschaftsergebnisse zu kommunizieren ist eine wichtige Sache. Vasco Elbrecht hat sich mit Eric Francavilla getroffen, um mehr über Wissenschaftskommunikation zu lernen. Eric Francavilla arbeitet mit einer Vielzahl von Wissenschaftlern des Pacific Northwest National Laboratory in Richland, Washington zusammen, und fungiert als Schnittstelle zwischen den öffentlichen Medien und Wissenschaftlern. Genau wie das GeneStream-Team, produziert er eine Vielzahl von YouTube […]

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SFS 2015 meeting, USA

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Vasco Elbrecht hat die aktuellen Metabarcoding Ergebnisse auf der Jahrestagung der Society for Freshwater Sciences (SFS 2015) in Milwaukee (USA) vorgestellt. Unsere Experimente zeigen, dass DNA-basierte Methoden grundsätzlich zur Gewässerbewertung geeignet sind, jedoch keine Taxa Abundanzen generieren können. Die Daten wurden bei der Zeitschrift PLOS ONE zur Publikation akzeptiert, sind aber schon jetzt als PrePrint […]

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Weiteres Steinfliegen-Mitogenom veröffentlicht!

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Wir freuen uns, ein weiteres Steinfliegen-Mitogenom veröffentlicht zu haben. Wir haben das mitochondriale Genom der Steinfliege Mesocapnia arizonensis aus bereits in Datenbanken hinterlegten Illumina-Sequenzen zusammengebaut. Das PDF zu dieser Publikation ist hier auf ResearchGate kostenlos erhältlich.

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Metabarcoding: Proben aus Finnland angekommen!

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In Zusammenarbeit mit unserem Projektpartner Kristian Meissner vom Finnischen Umweltinstitut SYKE werden wir bald den ersten großen Metabacoding Test staten, in dem wir die Invertebraten-Gemeinschaften von 30 finnischen Gewässern mit DNA-basierten Methoden charakterisieren. Die dazu benötigenden Proben sind diese Woche angekommen und werden innerhalb der nächsten Wochen im Labor bearbeitet. Foto 1: Über 30 Einzelproben stehen nun […]

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GBOL1 Workshop 2015

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Am 27. und 28. März 2015 fand ein 2-tägiger Workshop des GBOL1-Projektes (German Barcode of Life) am Zoologischen Forschungsmuseum Alexander Koenig in Bonn statt, auf dem auch das GeneStream-Team vertreten war. Neben der Präsentation des aktuellen Standes des GBOL-Projektes sowie zahlreicher Einzelprojekte, fand ein reger Austausch zwischen Experten verschiedener Tiergruppen statt. Hier geht es zu […]

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GfBS Tagung Bonn

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Diese Woche sind Arne und Florian vom GeneStream-Team, zusammen mit Alexander Weigand und Lars Dietz vom Lehrstuhl für Evolutionsökologie und Biodiversität der Tiere, auf der 16. Jahrestagung der Gesellschaft für Biologische Systematik (GfBS). Thema der Tagung ist: „Der Bedarf an taxonomischem Wissen – für wen und in welcher Form?“. Neben Ergebnissen aus unserem Projekt hält […]

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Entomologie-Tagung Frankfurt

Goethe Uni Frankfurt

Vom 2.3.-5.3. fand in Frankfurt a.M. die diesjährige Tagung der Deutschen Gesellschaft für allgemeine und angewandte Entomologie (DGaaE) statt. Unser Kollege Steffen Pauls vom BiK-F in Frankfurt hatte im Rahmen der Tagung eine Session zum Thema „Aquatic Entomology“ organisiert, in welcher Florian einen Vortrag zum Thema „Can DNA based freshwater biodiversity assessments quantify species abundances?“ […]

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Vortrag an der Universität Koblenz-Landau

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Am 19.2.2015 war Florian an der Universität Koblenz-Landau auf dem Campus Landau zu einem Kolloquiumsvortrag der AG „Ökotoxikologie und Umwelt“ mit dem Titel „“The potential of genetic tools to study stressor impacts on freshwater biodiversity“ eingeladen.

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Vortrag an der Universität Toulouse

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Am 4. Dezember 2014 war Florian an der Université Toulouse III (Paul Sabatier) am Laboratoire Evolution et Diversite Biologique zu einem Kolloquiumsvortrag mit dem Titel „From genes to ecosystems – What is the benefit of integrating the level of genetic diversity to study freshwater ecosystems under stress?“ eingeladen. Am Institut arbeitet u.a. Maria Alp, die ebenfalls […]

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GBOL Workshop Bonn

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Am 24. und 25. Januar 2014 fand ein 2-tägiger Workshop des GBOL-Projektes (German Barcode of Life) am Zoologischen Forschungsmuseum Alexander Koenig in Bonn statt, auf dem auch das GeneStream-Team vertreten war. Neben der Vorstellung zahlreicher Einzelprojekte, fand ein reger Austausch zwischen Experten verschiedener Tiergruppen statt. Hier geht es zu dem Artikel: www.bolgermany.de/news-publikationen   Die Teilnehmer des […]

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Aufnahme in Graduiertenschule IGB

Martina

Im Rahmen der Internationalen Graduiertenschule Biowissenschaften (IGB) haben gestern die Doktoranden Arne Beermann, Hannah Schweyen, Martina Weiss und Vasco Elbrecht (GeneStream Projekt) gemeinsam mit Jan Macher (LS Evolutionsökologie) die Konzepte ihrer Dissertationsprojekte verteidigt. Dies ist Voraussetzung für eine Dissertation an der Fakultät für Biologie und Biotechnologie. Herzlichen Glückwunsch zu den erfolgreichen Vorstellungen! Foto: Martina bei […]

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Vortrag EAWAG (Schweiz)

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Am 27. November 2014 war Florian Leese an der EAWAG bei Zürich zu einen Vortrag über die neuesten Ergebnisse des GeneStream Projekts eingeladen. Die Einladung war mit einem Besuch und wissenschaftlichem Austausch in der Arbeitsgruppe von Florian Altermatt verbunden. Die Gruppe von Florian Altermatt untersucht grundlegende Fragen zum Vorkommen von Fließwassertaxa in Raum und Zeit, insbesondere […]

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Akademientag 2014

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Am 24. November 2014 fand in der Bayrischen Akademie der Wissenschaften (BADW) der diesjährige Akademientag der acht in der Akademienunion zusammengeschlossenen Wissenschaftsakademien zum Thema „Wasser – Lebensgrundlage und Konfliktstoff“ statt (hier zur offiziellen Seite). Neben Plenarvorträgen und Workshops zu unterschiedlichen Themen rund um „Wasser“ wurden 14 wissenschaftliche Projekte durch Mitglieder der Wissenschaftsakademien bzw. Wissenschaftler aus […]

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Neue Veröffentlichung

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Eine neue Publikation von Martina Weiss aus dem GeneStream Team ist in Hydrobiologia erschienen. In der Arbeit wird gezeigt, dass die Anzahl übersehener Arten innerhalb des Krebses „Gammarus fossarum“ deutlich größer ist als bislang angenommen. Hydrobiologia January 2014, Volume 721, Issue 1, pp 165-184 Molecular evidence for further overlooked species within the Gammarus fossarumcomplex (Crustacea: Amphipoda) Martina Weiss, Jan […]

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Webseiten update

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Wir arbeiten aktuell daran den Inhalt der Seite sowohl auf Englisch als auch auf Deutsch anzubieten (siehe Auswahl auf der Seite unten links). Die Umstellung dauert noch ein paar Tage.

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Gastwissenschaftlerin zu Besuch

Katarina Goffova

Seit letzter Woche ist Katarina Goffova vom Institut für Zoologie der slowakischen Akademie der Wissenschaften (Bratislava) für 3 Wochen bei uns zu Gast. Während ihres Aufenthalts wird sie durch die Zusammenarbeit mit Mitarbeitern des GeneStream Teams und Maximilian Schweinsberg von unserem LS Evolutionsökologie und Biodiversität der Tiere ihr molekulargenetisches und bioinformatische Methodenspektrum erweitern. Herzlich Willkommen!

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Populationsgenetik- + Phylogeniekurs

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Seit drei Wochen läuft am Lehrstuhl für Evolutionsökologie und Biodiversität der Tiere der jährlich stattfindende Fortgeschrittenenkurs „Populationsgenetik und Phylogenie“. Im Zentrum des Kurses steht das Vermitteln praktischer Fertigkeiten (Labor/Bioinformatik) und theoretischer Konzepte in der Populationsgenetik und Phylogenie. Wie auch im letzten Jahr ist das GeneStream Team wie auch andere Mitarbeiter des Lehrstuhls massiv in die […]

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Zeitraffer-Videos als Playlist

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Auf unserem neuen offiziellen GeneStream YouTube Channel, sind nun alle Zeitraffer Aufnahmen vom Mesokosmos Experiment am Breitenbach verfügbar. Das neue Experiment ist bereits in Planung. Wir werden auch in diesem Jahr wieder neue Videos zu aktuellen Projekten veröffentlichen.  

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