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University of Duisburg and Essen, Aquatic Ecosystems Research Group, Universitätsstr. 5, D-45141 Essen, Germany

News

Labwork started!

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In the past week we started to process samples for the metabarcoding analysis. By combining classical CO1 barcoding to identify specimens with high throughput next generation sequencing, we will be able to identify hundreds to thousands of invertebrate specimens simultaneously. Implementing this novel technique for freshwater invertebrates will be useful to study the response of […]

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Experiment successfully completed!

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Yesterday, we have successfully completed our mesocosm experiment at the Felderbach in Germany. We started early in the morning to collect all animals, algae and leaf packs from the experimental channels. We and our colleges will analyse and test for a variety of response variables to the different stressors from microbiota to insect communities.Here you […]

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(Deutsch) Umweltstress bei Bachkrebsen

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Sampling Sauerland

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(Deutsch) Hauptphase Experiment

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Seeding of macrozoobenthos

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Few days ago we collected and added several thousand macroozoobenthic organisms from the Felderbacht into the experimental channels. This additional “seeding” step is important, as not all organisms enter the channels via the natural drift from the stream. By the extensive sampling of invertebrates in the river and randomised distribution into all 64 channels, we […]

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Talk at the 6th Groundwater conference

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IFWW price awarded

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Vasco Elbrecht has been awarded the Price of the Institute for the Advancement of Waterquality and Management (IFWW). His Master’s thesis about the genetic diversity and connectivity of the stonefly Dinocras cephalotes has been evaluated by a jury in a highly competitive two-step process. The award includes a prize money of 1500 €. Congratulations! The results have […]

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Symposium on Climate Change

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On March 20th 2014 a Climate Change symposium is organised at the North-Rhine Westphalian Academy of Sciences (Düsseldorf). The symposium has been organised by Florian Leese and three of his colleagues of the Junges Kolleg of the Academy. Further information on the symposium can be found here (in German only). http://aktuell.ruhr-uni-bochum.de/pm2014/pm00030.html.de

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Experiment has started

We have finished the experimental setup and since last Saturday (8.3.) the experiment is now running. Over the course of the next 3 weeks, organisms from the natural drift of the small stream, the Felderbach, will colonise our experimental channels. After the initial colonisation phase, we will test for the impact of different anthropogenic stressors […]

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Experimental setup day 2 and 3

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Over the past two days we have continued with our work on the experimental setup. Picture 1: We drilled 64 holes in the wooden planks, so the water can leave the channels. Picture 2: Substrate for the mesocosms was taken directly from the river and dried on a plane. Picture 3: With a wooden construction […]

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New Publication

We have just published an article in a special issue of the US American Journal “Freshwater Science” which deals specifically with “Molecular Approaches in Freshwater Ecology”. Vasco Elbrecht of the GeneStream Team is the lead author of the study. Our paper highlights the potential of genetic approaches for addressing and answering ecological questions. The work […]

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Experimental setup has started

Today we have started with the setup of the ExStream mesocosm field experiment at the Felderbach (Hattingen, North Rhine-Westphalia, Germany). The scaffolding was set up and pumps installed. In the next days the setup will be completed and we can start with the experiment next monday. Picture 1: Today all necessary equipment was brought to […]

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Our Team is growing

This week, Lisa Poettker and Basel Shaaban have joined the GeneStream Team. Welcome! Both will work in the population genomic subproject. Together with Hannah, Martina and Florian, Basel will develop population genetic null models of gene flow in fragmented stream ecosystems with simulation approaches. Lisa will process samples of stream invertebrates for the RAD-sequencing.

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Pump tests at Felderbach

Today, we have tested the water pumps for the next field experiment at the Felderbach. All tests were passed successfully and we can start with the assembly of the ExStream system in early March. In parallel, we are drafting the publication of the results of the experiment at the Breitenbach last year. Photo 1: Vasco […]

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Besuch am IGB – Stechlinsee

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Diese Woche war Vasco Elbrecht am Leibniz-Institut für Gewässerökologie und Binnenfischerei (IGB am Stechlinsee, Abteilung für experimentelle Limnologie) eingeladen, um über die Ergebnisse der populationsgenetischen Masterarbeit sowie aktuelle Forschungsvorhaben im Rahmen des GeneStream Projektes zu sprechen. Wir bedanken bei den Mitarbeitern des IGB, besonders bei Jörg Sareyka, für den interessanten Einblick in die wissenschaftlichen Projekte, die […]

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GeneStream Team auf der 4. WRHC

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Diese Woche war das GeneStream Team auf der 4. Water Research Horizon Conference (4. WRHC) in Berlin vertreten. Junior Forschergruppenleiter Dr. Florian Leese und Professor Ralph Tollrian haben im Rahmen der Konferenz die offizielle Urkunde für die Förderung des GeneStream Projekts  von dem Kuratorium der Bode Stiftung entgegen genommen. In dem Abendvortrag der Konferenz referierte Florian Leese über Konzept und […]

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Site surveys

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Aktuell führen wir im Sauerland am Oberlauf der Ruhr und Lenne Surveys durch, um geeignete Probestellen für die populationsgenomischen Untersuchungen zu finden. Hierbei konzentrieren wir uns auf Gewässer mit natürlichen vs. extrem anthropogen-beeinflussten/verbauten Abschnitten. Unten sind einige Eindrücke der Arbeiten zu sehen.        

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Bilder Aufbau ExStream System

Hier eine kurze Übersicht über Bilder vom Aufbau des Experimentalrinnensystems am Breitenbach:   Bild 1: Das ExStream System – nahezu einsatzbereit. Bild 2: Auswahl und Vorbereitung der Sohlsubstrate für das Fließrinnenexperiment Bild 3: Murray McKenzy, leitender Techniker vom Department of Zoology der Universität von Otago (Neuseeland) beim Aufbau des ExStream Systems am Breitenbach. Bild 4: […]

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Der Aufbau ist nahezu abgeschlossen

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Heute konnten wir erfolgreich die Pumpen starten und alle 64 Fließrinnen mit der benötigten Wassermenge bedienen. Morgen startet das Experiment – die Sohlsubstrate für die Rinnen sind vermessen und getrocknet.  

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Neues Genetiklabor in Betrieb

Nach längeren Umzugs- und Renovierungsarbeiten ist heute das neue Next-Generation Sequencing Labor des Lehrstuhls für Evolutionsökologie und Biodiversität der Tiere in Betrieb genommen worden. In dem Labor werden wir vor allem sensible Arbeiten durchgeführt, wie z.B. die Vorbereitung  genetischer “Libraries” für die Hochdurchsatzanalysen auf  Illumina-Sequenzieren. Hierzu stehen uns entsprechend spezielle Analysegeräte zur Verfügung. Im Rahmen […]

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Emergenzfalle in Betrieb

Die große Emergenzfalle T2 am Breitenbach ist wieder in Betrieb. Mit der Falle werden wir die Artenvielfalt aquatischer Insekten über 1 Jahr inventarisieren. Hierzu ist zunächst eine exakte morphologische Bestimmung der zahlreichen Arten notwendig. In Zusammenarbeit mit dem German Barcode of Life Projekt (GBOL) werden sogenannte “DNA Barcodes” für die Arten erhoben. Über diese charakteristischen […]

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Ein regnerischer Tag

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Auch heute wurde am Experiment fleißig weiter gearbeitet, trotz strömenden Regens. Der Breitenbach macht seinem Namen somit alle Ehre und ist inzwischen zu einem kleinen “Fluss” herangewachsen. Foto 1: Manchmal helfen auch große Schirme und Regenkleidung nicht. Foto 2: Der Breitenbach… ist etwas breiter geworden. Foto 3: Die Fläche beim Experiment gleicht immer mehr einer […]

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Catch of the day

Das gute Wetter heute hat zur Emergenz zahlreicher Arten geführt. Einen kleiner Eindruck davon ist in dem Foto unten zu sehen. Foto: Aufsicht auf den Fang des Tages aus der Emergenzfalle.

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Der Aufbau ist in vollem Gang!

Heute haben wir unser experimentelles Setup am Breitenbach weitgehend aufbauen können. Morgen müssen noch Löcher für den Wasserablauf gebohrt und einige Kleinigkeiten besorgt werden. Auch heute haben wir ein Zeitraffer-Video vom Aufbau aufgenommen:

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